西南医科大学附属中医医院药物临床试验机构于2013年12月开始筹建，2017年5月15日正式通过国家食品药品监督管理局药物临床试验机构资格认定，14个专业通过资格认定。2018年1月，我院完成医疗器械临床试验机构备案，备案号为：械临机构备201800023,共27个专业组备案。2020年7月完成药物临床试验机构备案工作。备案号为：药临床机构备字2020000454。目前备案的药物临床试验专业组为：中医神经内科、中医心血管、中医呼吸、中医消化（肝胆）、中医消化（脾胃）、中医耳鼻咽喉、麻醉、疼痛、I期药物临床研究室(48张床位)。各专业组均具备先进的医疗设施和丰富的临床专家，能保证药物临床试验遵循伦理、科学原则，确保临床试验安全有效地进行，尽可能保证受试者安全。
    本机构统一负责本院临床试验项目管理。下设机构办公室、质控办公室、档案资料室、中心药库及资料查阅室，位于第二住院大楼3楼，建筑面积约300m²，配备相应的设施设备，完全能满足工作要求。机构将秉承“德业并修，精诚致远”的医院院训，不断完善机构组织建设和质量控制体系，保证临床试验过程规范，数据和结果的科学、真实、可靠，保护受试者权益和安全；以严谨的科学态度、标准化的操作规程和严格的监管制度，认真完成每一项临床试验，为我国的临床研究事业贡献一份力量。